Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1I0

Lyg2, Lysozyme g-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyg2Q3V1I0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lyg2Q3V1I0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lyg2Q3V1I0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lyg2Q3V1I0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lyg2Q3V1I0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lyg2Q3V1I0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lyg2Q3V1I0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms