Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ckap2Q3V1H1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ckap2Q3V1H1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ckap2Q3V1H1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ckap2Q3V1H1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ckap2Q3V1H1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ckap2Q3V1H1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ckap2Q3V1H1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Ckap2Q3V1H1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ckap2Q3V1H1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ckap2Q3V1H1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms