Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
4930567H17RikQ3V0K5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
4930567H17RikQ3V0K5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
4930567H17RikQ3V0K5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
4930567H17RikQ3V0K5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms