Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTJ2

Sorbs2, Sorbin and SH3 domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs2Q3UTJ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs2Q3UTJ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sorbs2Q3UTJ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs2Q3UTJ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs2Q3UTJ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sorbs2Q3UTJ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs2Q3UTJ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sorbs2Q3UTJ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sorbs2Q3UTJ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sorbs2Q3UTJ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sorbs2Q3UTJ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sorbs2Q3UTJ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sorbs2Q3UTJ2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sorbs2Q3UTJ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs2Q3UTJ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sorbs2Q3UTJ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs2Q3UTJ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs2Q3UTJ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs2Q3UTJ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sorbs2Q3UTJ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sorbs2Q3UTJ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms