Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Zswim8Q3UHH1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Zswim8Q3UHH1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Zswim8Q3UHH1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Zswim8Q3UHH1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Zswim8Q3UHH1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Zswim8Q3UHH1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zswim8Q3UHH1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Zswim8Q3UHH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Zswim8Q3UHH1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zswim8Q3UHH1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zswim8Q3UHH1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Zswim8Q3UHH1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Zswim8Q3UHH1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Zswim8Q3UHH1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zswim8Q3UHH1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms