Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trmt1Q3TX08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trmt1Q3TX08 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Trmt1Q3TX08 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trmt1Q3TX08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trmt1Q3TX08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Trmt1Q3TX08 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trmt1Q3TX08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms