Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col19a1Q0VF58 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col19a1Q0VF58 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col19a1Q0VF58 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col19a1Q0VF58 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col19a1Q0VF58 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col19a1Q0VF58 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col19a1Q0VF58 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Col19a1Q0VF58 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms