Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ubxn2bQ0KL01 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ubxn2bQ0KL01 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ubxn2bQ0KL01 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ubxn2bQ0KL01 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ubxn2bQ0KL01 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ubxn2bQ0KL01 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ubxn2bQ0KL01 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ubxn2bQ0KL01 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ubxn2bQ0KL01 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ubxn2bQ0KL01 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ubxn2bQ0KL01 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ubxn2bQ0KL01 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ubxn2bQ0KL01 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ubxn2bQ0KL01 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ubxn2bQ0KL01 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ubxn2bQ0KL01 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ubxn2bQ0KL01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ubxn2bQ0KL01 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ubxn2bQ0KL01 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ubxn2bQ0KL01 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubxn2bQ0KL01 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms