Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd8Q09XV5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd8Q09XV5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd8Q09XV5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd8Q09XV5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Chd8Q09XV5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chd8Q09XV5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms