Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cass4Q08EC4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cass4Q08EC4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cass4Q08EC4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cass4Q08EC4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cass4Q08EC4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cass4Q08EC4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms