Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf9Q07105 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf9Q07105 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf9Q07105 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf9Q07105 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gdf9Q07105 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdf9Q07105 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms