Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hivep1Q03172 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hivep1Q03172 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hivep1Q03172 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hivep1Q03172 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hivep1Q03172 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hivep1Q03172 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms