Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Yy1Q00899 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Yy1Q00899 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Yy1Q00899 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Yy1Q00899 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Yy1Q00899 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Yy1Q00899 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Yy1Q00899 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Yy1Q00899 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Yy1Q00899 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Yy1Q00899 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Yy1Q00899 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Yy1Q00899 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Yy1Q00899 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Yy1Q00899 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Yy1Q00899 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Yy1Q00899 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Yy1Q00899 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Yy1Q00899 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Yy1Q00899 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Yy1Q00899 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Yy1Q00899 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Yy1Q00899 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms