Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Uba52P62984 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Uba52P62984 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Uba52P62984 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Uba52P62984 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uba52P62984 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba52P62984 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba52P62984 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba52P62984 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba52P62984 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba52P62984 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba52P62984 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba52P62984 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uba52P62984 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uba52P62984 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uba52P62984 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba52P62984 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba52P62984 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba52P62984 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uba52P62984 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba52P62984 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uba52P62984 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms