Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp5bP56480 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp5bP56480 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp5bP56480 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp5bP56480 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5bP56480 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5bP56480 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5bP56480 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp5bP56480 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp5bP56480 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5bP56480 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp5bP56480 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp5bP56480 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5bP56480 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms