Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PcntP48725 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PcntP48725 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PcntP48725 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PcntP48725 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PcntP48725 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PcntP48725 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PcntP48725 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PcntP48725 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PcntP48725 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PcntP48725 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PcntP48725 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PcntP48725 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PcntP48725 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PcntP48725 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PcntP48725 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PcntP48725 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PcntP48725 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PcntP48725 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PcntP48725 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PcntP48725 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PcntP48725 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PcntP48725 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PcntP48725 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PcntP48725 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PcntP48725 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PcntP48725 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PcntP48725 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PcntP48725 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PcntP48725 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PcntP48725 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PcntP48725 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PcntP48725 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PcntP48725 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PcntP48725 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PcntP48725 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PcntP48725 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PcntP48725 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PcntP48725 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PcntP48725 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PcntP48725 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PcntP48725 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PcntP48725 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PcntP48725 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PcntP48725 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PcntP48725 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PcntP48725 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PcntP48725 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PcntP48725 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PcntP48725 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PcntP48725 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PcntP48725 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PcntP48725 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PcntP48725 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PcntP48725 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PcntP48725 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PcntP48725 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PcntP48725 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcntP48725 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcntP48725 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PcntP48725 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PcntP48725 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PcntP48725 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PcntP48725 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PcntP48725 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PcntP48725 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PcntP48725 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PcntP48725 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcntP48725 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcntP48725 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcntP48725 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PcntP48725 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PcntP48725 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PcntP48725 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PcntP48725 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PcntP48725 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PcntP48725 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcntP48725 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcntP48725 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PcntP48725 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PcntP48725 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PcntP48725 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PcntP48725 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcntP48725 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PcntP48725 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PcntP48725 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PcntP48725 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcntP48725 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcntP48725 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcntP48725 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcntP48725 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcntP48725 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcntP48725 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcntP48725 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PcntP48725 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PcntP48725 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PcntP48725 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PcntP48725 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PcntP48725 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PcntP48725 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms