Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighmbp2P40694 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighmbp2P40694 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighmbp2P40694 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ighmbp2P40694 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ighmbp2P40694 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ighmbp2P40694 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ighmbp2P40694 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ighmbp2P40694 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ighmbp2P40694 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ighmbp2P40694 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ighmbp2P40694 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ighmbp2P40694 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ighmbp2P40694 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ighmbp2P40694 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ighmbp2P40694 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ighmbp2P40694 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ighmbp2P40694 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ighmbp2P40694 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ighmbp2P40694 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms