Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Chd1P40201 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Chd1P40201 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Chd1P40201 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Chd1P40201 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Chd1P40201 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Chd1P40201 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Chd1P40201 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Chd1P40201 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Chd1P40201 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Chd1P40201 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Chd1P40201 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Chd1P40201 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Chd1P40201 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Chd1P40201 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Chd1P40201 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Chd1P40201 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Chd1P40201 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Chd1P40201 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Chd1P40201 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Chd1P40201 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Chd1P40201 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Chd1P40201 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Chd1P40201 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Chd1P40201 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Chd1P40201 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Chd1P40201 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Chd1P40201 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Chd1P40201 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Chd1P40201 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Chd1P40201 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Chd1P40201 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Chd1P40201 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Chd1P40201 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Chd1P40201 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Chd1P40201 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Chd1P40201 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Chd1P40201 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Chd1P40201 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Chd1P40201 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Chd1P40201 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Chd1P40201 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Chd1P40201 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Chd1P40201 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Chd1P40201 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Chd1P40201 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Chd1P40201 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Chd1P40201 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Chd1P40201 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Chd1P40201 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Chd1P40201 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Chd1P40201 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Chd1P40201 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Chd1P40201 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Chd1P40201 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Chd1P40201 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms