Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sar1aP36536 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sar1aP36536 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sar1aP36536 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1aP36536 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sar1aP36536 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sar1aP36536 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms