Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd10P28359 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hoxd10P28359 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Hoxd10P28359 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxd10P28359 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxd10P28359 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxd10P28359 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxd10P28359 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxd10P28359 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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