Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsgP28293 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsgP28293 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtsgP28293 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtsgP28293 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CtsgP28293 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtsgP28293 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsgP28293 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtsgP28293 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsgP28293 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms