Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HdcP23738 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HdcP23738 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HdcP23738 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HdcP23738 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HdcP23738 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HdcP23738 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HdcP23738 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HdcP23738 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HdcP23738 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HdcP23738 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HdcP23738 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HdcP23738 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HdcP23738 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HdcP23738 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HdcP23738 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HdcP23738 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HdcP23738 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HdcP23738 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HdcP23738 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HdcP23738 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HdcP23738 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HdcP23738 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HdcP23738 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HdcP23738 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HdcP23738 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HdcP23738 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HdcP23738 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HdcP23738 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HdcP23738 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HdcP23738 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HdcP23738 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HdcP23738 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HdcP23738 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HdcP23738 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HdcP23738 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HdcP23738 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HdcP23738 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HdcP23738 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HdcP23738 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HdcP23738 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HdcP23738 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HdcP23738 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HdcP23738 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HdcP23738 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HdcP23738 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HdcP23738 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HdcP23738 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HdcP23738 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HdcP23738 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HdcP23738 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HdcP23738 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HdcP23738 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HdcP23738 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HdcP23738 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HdcP23738 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HdcP23738 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HdcP23738 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HdcP23738 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HdcP23738 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HdcP23738 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HdcP23738 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HdcP23738 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HdcP23738 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HdcP23738 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HdcP23738 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HdcP23738 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HdcP23738 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HdcP23738 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdcP23738 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdcP23738 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HdcP23738 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HdcP23738 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HdcP23738 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdcP23738 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdcP23738 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdcP23738 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HdcP23738 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HdcP23738 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HdcP23738 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HdcP23738 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdcP23738 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HdcP23738 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdcP23738 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdcP23738 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HdcP23738 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdcP23738 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdcP23738 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdcP23738 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdcP23738 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HdcP23738 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HdcP23738 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdcP23738 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HdcP23738 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdcP23738 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HdcP23738 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdcP23738 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms