Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf1P15314 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf1P15314 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf1P15314 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf1P15314 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irf1P15314 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf1P15314 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf1P15314 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf1P15314 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf1P15314 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf1P15314 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf1P15314 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf1P15314 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf1P15314 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf1P15314 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf1P15314 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irf1P15314 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irf1P15314 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms