Protein–RNA interactions for Protein: P11881

Itpr1, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr1P11881 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itpr1P11881 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Itpr1P11881 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itpr1P11881 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itpr1P11881 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itpr1P11881 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itpr1P11881 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itpr1P11881 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itpr1P11881 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itpr1P11881 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itpr1P11881 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Itpr1P11881 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itpr1P11881 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms