Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt8P11679 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt8P11679 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt8P11679 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt8P11679 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt8P11679 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt8P11679 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt8P11679 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt8P11679 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt8P11679 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt8P11679 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt8P11679 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt8P11679 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt8P11679 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt8P11679 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt8P11679 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt8P11679 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt8P11679 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt8P11679 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms