Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spta1P08032 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spta1P08032 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spta1P08032 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spta1P08032 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spta1P08032 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spta1P08032 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spta1P08032 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spta1P08032 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spta1P08032 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spta1P08032 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spta1P08032 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spta1P08032 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spta1P08032 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spta1P08032 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spta1P08032 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms