Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp2a2O55143 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp2a2O55143 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp2a2O55143 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp2a2O55143 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2a2O55143 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms