Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NlkO54949 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NlkO54949 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NlkO54949 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NlkO54949 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NlkO54949 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NlkO54949 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NlkO54949 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NlkO54949 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NlkO54949 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NlkO54949 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NlkO54949 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NlkO54949 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NlkO54949 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NlkO54949 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NlkO54949 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NlkO54949 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NlkO54949 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NlkO54949 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NlkO54949 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NlkO54949 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NlkO54949 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NlkO54949 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NlkO54949 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NlkO54949 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NlkO54949 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NlkO54949 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NlkO54949 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NlkO54949 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NlkO54949 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NlkO54949 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NlkO54949 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NlkO54949 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NlkO54949 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NlkO54949 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NlkO54949 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NlkO54949 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NlkO54949 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NlkO54949 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NlkO54949 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NlkO54949 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NlkO54949 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NlkO54949 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NlkO54949 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NlkO54949 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NlkO54949 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NlkO54949 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NlkO54949 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NlkO54949 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NlkO54949 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NlkO54949 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NlkO54949 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NlkO54949 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NlkO54949 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NlkO54949 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NlkO54949 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NlkO54949 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NlkO54949 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NlkO54949 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NlkO54949 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NlkO54949 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NlkO54949 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NlkO54949 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NlkO54949 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NlkO54949 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NlkO54949 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NlkO54949 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NlkO54949 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NlkO54949 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NlkO54949 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NlkO54949 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NlkO54949 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NlkO54949 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NlkO54949 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NlkO54949 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NlkO54949 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NlkO54949 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NlkO54949 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NlkO54949 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NlkO54949 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NlkO54949 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NlkO54949 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NlkO54949 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NlkO54949 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NlkO54949 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NlkO54949 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NlkO54949 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NlkO54949 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NlkO54949 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NlkO54949 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NlkO54949 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NlkO54949 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NlkO54949 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NlkO54949 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NlkO54949 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NlkO54949 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NlkO54949 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NlkO54949 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NlkO54949 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NlkO54949 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms