Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chil3O35744 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chil3O35744 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chil3O35744 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chil3O35744 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chil3O35744 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chil3O35744 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chil3O35744 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chil3O35744 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chil3O35744 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chil3O35744 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chil3O35744 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms