Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf11O35235 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf11O35235 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf11O35235 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf11O35235 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms