Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8356J3QPD3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8356J3QPD3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8356J3QPD3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8356J3QPD3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8356J3QPD3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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