Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3099J3QPA5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3099J3QPA5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3099J3QPA5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm3099J3QPA5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3099J3QPA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms