Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW1

Gm7137, MCG1044197, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7137J3QMW1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm7137J3QMW1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm7137J3QMW1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm7137J3QMW1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm7137J3QMW1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm7137J3QMW1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm7137J3QMW1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm7137J3QMW1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm7137J3QMW1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm7137J3QMW1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7137J3QMW1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm7137J3QMW1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms