Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gm20873J3QMQ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm20873J3QMQ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm20873J3QMQ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Gm20873J3QMQ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Gm20873J3QMQ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20873J3QMQ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20873J3QMQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Gm20873J3QMQ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20873J3QMQ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20873J3QMQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20873J3QMQ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20873J3QMQ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20873J3QMQ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20873J3QMQ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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