Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21818J3KMS6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21818J3KMS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21818J3KMS6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21818J3KMS6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21818J3KMS6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm21818J3KMS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms