Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
5830473C10RikF8VQ07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
5830473C10RikF8VQ07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
5830473C10RikF8VQ07 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
5830473C10RikF8VQ07 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
5830473C10RikF8VQ07 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
5830473C10RikF8VQ07 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms