Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20538F6Z9R1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20538F6Z9R1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20538F6Z9R1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20538F6Z9R1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20538F6Z9R1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms