Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf4E9QAP7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf4E9QAP7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf4E9QAP7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf4E9QAP7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf4E9QAP7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Taf4E9QAP7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf4E9QAP7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms