Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga10E9Q6R1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga10E9Q6R1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga10E9Q6R1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itga10E9Q6R1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga10E9Q6R1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga10E9Q6R1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms