Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2X2

Dnhd1, Dynein heavy chain domain 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnhd1D3Z2X2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dnhd1D3Z2X2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnhd1D3Z2X2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Dnhd1D3Z2X2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dnhd1D3Z2X2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Dnhd1D3Z2X2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Dnhd1D3Z2X2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dnhd1D3Z2X2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms