Protein–RNA interactions for Protein: B8JJZ9

Zfp563, Zinc finger protein 563, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp563B8JJZ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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Zfp563B8JJZ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp563B8JJZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Zfp563B8JJZ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Zfp563B8JJZ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Zfp563B8JJZ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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Zfp563B8JJZ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp563B8JJZ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp563B8JJZ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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