Protein–RNA interactions for Protein: B1B1D3

Zfp40, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp40B1B1D3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp40B1B1D3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp40B1B1D3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp40B1B1D3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp40B1B1D3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp40B1B1D3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp40B1B1D3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp40B1B1D3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms