Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfrsf25B1AWN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf25B1AWN9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf25B1AWN9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf25B1AWN9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf25B1AWN9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf25B1AWN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms