Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pramef17A2ASJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Pramef17A2ASJ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pramef17A2ASJ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pramef17A2ASJ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pramef17A2ASJ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pramef17A2ASJ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pramef17A2ASJ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms