Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef25A2ASI9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef25A2ASI9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramef25A2ASI9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramef25A2ASI9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramef25A2ASI9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef25A2ASI9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef25A2ASI9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pramef25A2ASI9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramef25A2ASI9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms