Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Prdm2A2A7B5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Prdm2A2A7B5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Prdm2A2A7B5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Prdm2A2A7B5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Prdm2A2A7B5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Prdm2A2A7B5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Prdm2A2A7B5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Prdm2A2A7B5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Prdm2A2A7B5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Prdm2A2A7B5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Prdm2A2A7B5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Prdm2A2A7B5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Prdm2A2A7B5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prdm2A2A7B5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prdm2A2A7B5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Prdm2A2A7B5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Prdm2A2A7B5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Prdm2A2A7B5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Prdm2A2A7B5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Prdm2A2A7B5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Prdm2A2A7B5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Prdm2A2A7B5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Prdm2A2A7B5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms