Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PtprbB2RU80 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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PtprbB2RU80 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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PtprbB2RU80 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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PtprbB2RU80 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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PtprbB2RU80 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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PtprbB2RU80 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PtprbB2RU80 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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