Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edf1Q9JMG1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edf1Q9JMG1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms