Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR5

Tcf23, Transcription factor 23, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf23Q9JLR5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcf23Q9JLR5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcf23Q9JLR5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms