Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Subh2bvQ9D9Z7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms